Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTAFRP25105 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms