Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB9P17482 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB9P17482 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms