Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms