Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALAP11233 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALAP11233 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALAP11233 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALAP11233 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RALAP11233 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RALAP11233 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RALAP11233 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RALAP11233 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RALAP11233 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RALAP11233 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RALAP11233 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RALAP11233 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RALAP11233 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RALAP11233 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms