Protein–RNA interactions for Protein: P10619

CTSA, Lysosomal protective protein, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSAP10619 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSAP10619 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSAP10619 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSAP10619 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSAP10619 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSAP10619 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSAP10619 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSAP10619 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSAP10619 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSAP10619 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSAP10619 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSAP10619 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSAP10619 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSAP10619 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSAP10619 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSAP10619 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSAP10619 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSAP10619 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSAP10619 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSAP10619 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSAP10619 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSAP10619 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSAP10619 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSAP10619 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSAP10619 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSAP10619 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSAP10619 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSAP10619 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSAP10619 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTSAP10619 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTSAP10619 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTSAP10619 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTSAP10619 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSAP10619 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSAP10619 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSAP10619 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSAP10619 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSAP10619 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTSAP10619 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSAP10619 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSAP10619 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSAP10619 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSAP10619 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTSAP10619 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTSAP10619 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSAP10619 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSAP10619 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSAP10619 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSAP10619 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSAP10619 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSAP10619 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSAP10619 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTSAP10619 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSAP10619 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSAP10619 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSAP10619 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSAP10619 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTSAP10619 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSAP10619 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSAP10619 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSAP10619 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSAP10619 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTSAP10619 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSAP10619 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSAP10619 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSAP10619 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSAP10619 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSAP10619 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms