Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms