Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXB7P09629 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB7P09629 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms