Protein–RNA interactions for Protein: P02708

CHRNA1, Acetylcholine receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA1P02708 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA1P02708 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA1P02708 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA1P02708 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA1P02708 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA1P02708 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA1P02708 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA1P02708 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA1P02708 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA1P02708 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA1P02708 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA1P02708 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA1P02708 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA1P02708 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA1P02708 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA1P02708 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms