Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX58O95786 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX58O95786 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX58O95786 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX58O95786 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX58O95786 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX58O95786 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX58O95786 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX58O95786 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX58O95786 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX58O95786 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX58O95786 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX58O95786 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX58O95786 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX58O95786 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX58O95786 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX58O95786 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX58O95786 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX58O95786 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX58O95786 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX58O95786 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX58O95786 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX58O95786 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX58O95786 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX58O95786 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX58O95786 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX58O95786 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX58O95786 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX58O95786 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX58O95786 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX58O95786 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX58O95786 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX58O95786 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX58O95786 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX58O95786 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX58O95786 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX58O95786 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX58O95786 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX58O95786 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX58O95786 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX58O95786 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX58O95786 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms