Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBOX1O75936 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBOX1O75936 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms