Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms