Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms