Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSSC4Q9Y5U2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms