Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRBQ9Y5M8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms