Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms