Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms