Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms