Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI4Q9UM07 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms