Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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