Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VAPAQ9P0L0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms