Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL28Q9NXS3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL28Q9NXS3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms