Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT57Q9NWB7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms