Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF3Q9NUQ8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCF3Q9NUQ8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms