Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOMER3Q9NSC5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms