Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms