Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF3Q9NRP4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms