Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYLDQ9NQC7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYLDQ9NQC7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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