Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms