Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms