Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF3Q9H4D5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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