Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSG1Q9H089 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms