Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4AQ9BY43 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms