Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms