Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL6Q9BWW8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL6Q9BWW8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms