Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RTKNQ9BST9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RTKNQ9BST9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RTKNQ9BST9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RTKNQ9BST9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RTKNQ9BST9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTKNQ9BST9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms