Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms