Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C2orf48Q96LS8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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