Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms