Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms