Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMD3Q96D46 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms