Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EAF2Q96CJ1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms