Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms