Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms