Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF4Q8WWF5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms