Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL11Q8NHH1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms