Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms