Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.932e-6■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.962e-6■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.897e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.447e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.697e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.874e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.714e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.514e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.444e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.134e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 MAP4K4-220ENST00000627726 3135 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.844e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.974e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.984e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.994e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 MAP4K4-209ENST00000421882 3416 ntTSL 58.64□□□□□ -1.034e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 TTC3-205ENST00000411496 893 ntTSL 38.49□□□□□ -1.054e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.064e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 SEC63-207ENST00000466419 606 ntTSL 38.23□□□□□ -1.094e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.144e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.24e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 TTC3-220ENST00000487711 925 ntTSL 57.04□□□□□ -1.284e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 MAP4K4-207ENST00000417294 4251 ntTSL 56.5□□□□□ -1.374e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 TTC3-206ENST00000414818 831 ntTSL 36.28□□□□□ -1.44e-10■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 CHD4-214ENST00000545942 1317 ntTSL 1 (best)21.72■■□□□ 1.073e-6■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.731e-6■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.361e-6■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 BTBD7-202ENST00000334746 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.661e-6■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 BTBD7-207ENST00000554968 316 ntTSL 23.27□□□□□ -1.891e-6■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 ZFPM2-202ENST00000511341 1582 ntTSL 1 (best)20.46■□□□□ 0.874e-8■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 ZFPM2-210ENST00000524235 574 ntTSL 48.85□□□□□ -0.994e-8■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 ZFPM2-205ENST00000520027 594 ntTSL 45.76□□□□□ -1.494e-8■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 CABIN1-206ENST00000454754 1321 ntTSL 1 (best)19.22■□□□□ 0.672e-8■■□□□ 13.7
AGGF1Q8N302 AC087482.1-202ENST00000558071 903 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.689e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.021e-6■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 RNF24-202ENST00000358395 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.361e-6■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-6■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.071e-6■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-221ENST00000479735 543 ntTSL 419.78■□□□□ 0.764e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.114e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-231ENST00000630572 468 ntTSL 513.71□□□□□ -0.214e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.294e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-237ENST00000636732 5073 ntTSL 512.82□□□□□ -0.364e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-202ENST00000392861 1514 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.44e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.464e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.694e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-224ENST00000539609 4061 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.724e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-209ENST00000435831 554 ntTSL 410.21□□□□□ -0.774e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-220ENST00000476394 601 ntTSL 310.18□□□□□ -0.784e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-201ENST00000303660 3913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.784e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-210ENST00000440875 1809 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.94e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-211ENST00000444559 577 ntTSL 49.06□□□□□ -0.964e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-207ENST00000431672 709 ntTSL 49.02□□□□□ -0.974e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.034e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-205ENST00000419938 1755 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.054e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-222ENST00000484313 845 ntTSL 1 (best)8.29□□□□□ -1.084e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-206ENST00000427902 2236 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.094e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-208ENST00000434448 583 ntTSL 58.15□□□□□ -1.14e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-216ENST00000465308 1071 ntTSL 58.15□□□□□ -1.14e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.124e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-240ENST00000637267 2677 ntTSL 57.86□□□□□ -1.154e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-212ENST00000453352 581 ntTSL 37.72□□□□□ -1.174e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-203ENST00000409211 587 ntTSL 46.38□□□□□ -1.394e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.454e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-242ENST00000637591 101 ntTSL 54.71□□□□□ -1.664e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-218ENST00000472146 3837 ntTSL 1 (best)4.36□□□□□ -1.714e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ZEB2-213ENST00000461784 751 ntTSL 33.95□□□□□ -1.784e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.494e-8■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.914e-8■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.914e-8■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 KTN1-208ENST00000459737 4793 ntTSL 1 (best)2.78□□□□□ -1.964e-8■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.984e-8■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.984e-8■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.164e-8■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 CENPC-205ENST00000510189 2917 ntTSL 1 (best)12.27□□□□□ -0.442e-12■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 CENPC-203ENST00000506882 3436 ntTSL 1 (best)11.02□□□□□ -0.642e-12■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.742e-12■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.241e-6■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 CENPC-202ENST00000506410 692 ntTSL 26.16□□□□□ -1.422e-12■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 CENPC-206ENST00000513216 2799 ntTSL 54.15□□□□□ -1.742e-12■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.012e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.812e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.762e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.632e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 GRB10-202ENST00000357271 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.32e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 GRB10-210ENST00000407526 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.432e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 GRB10-204ENST00000398812 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.842e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 GRB10-203ENST00000398810 4785 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.842e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 GRB10-209ENST00000406641 2700 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.852e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.992e-7■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.882e-29■■□□□ 13.6
AGGF1Q8N302 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.476e-9■■□□□ 13.5
AGGF1Q8N302 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.482e-9■■□□□ 13.5
AGGF1Q8N302 NUTM2A-AS1-210ENST00000451940 662 ntTSL 514.76□□□□□ -0.052e-9■■□□□ 13.5
AGGF1Q8N302 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.272e-9■■□□□ 13.5
AGGF1Q8N302 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.592e-9■■□□□ 13.5
AGGF1Q8N302 PFKFB3-218ENST00000639949 587 ntTSL 48.94□□□□□ -0.982e-9■■□□□ 13.5
AGGF1Q8N302 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.122e-9■■□□□ 13.5
AGGF1Q8N302 NOSTRIN-208ENST00000447264 794 ntTSL 57.21□□□□□ -1.262e-9■■□□□ 13.5
AGGF1Q8N302 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.322e-9■■□□□ 13.5
AGGF1Q8N302 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.432e-9■■□□□ 13.5
Retrieved 100 of 9,853 protein–RNA pairs in 81 ms