Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC141Q6ZP82 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC141Q6ZP82 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms