Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms