Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPH2Q6IBW4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPH2Q6IBW4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms